Das Hochland ist zwischen 1.300 und 1.800 m hoch. Dort gibt es Vulkane, die immer noch aktiv sind. Der höchste Berg des Landes ist der Vulkan Tajumulco (4.211 Meter). Diese Gegend ist besonders erdbebengefährdet.
Im Tiefland und an der Küste herrscht tropisches Klima. Der nördliche Teil des Landes ist größtenteils von tropischem Regenwald bedeckt.
Der größte See ist der Izabal-See. Er ist 48 km lang und 20 km breit.
Einer der schönsten Seen des Landes ist der Lago de Atitlán, der drittgrößte See Guatemalas. Er liegt rund 1.560 m hoch und ist umgeben von drei Vulkanen. Der See liegt in einem Krater, der durch die Explosion eines sehr großen Vulkans entstanden ist.